铃木园子（すずきそのこ）
配音演员：松井菜樱子
小兰、小梓的同学、好友，铃木家次女。虽然出身富家，不过却毫无大小姐的架子，和周围朋友的关系都很不错，性格十分开朗豪放。曾经因找不到男朋友而苦恼，并此羡慕小兰和新一；目前和京极真交往中。
铃木史郎（すずき しろう）
配音演员：松冈文雄
铃木财团的会长，园子的父亲。
铃木朋子（すずき ともこ）
配音演员：一柳みる
园子的母亲。一心希望与怪盗基德对决且战胜怪盗基德铃木绫子（すずき あやこ）
配音演员：元井须美子→铃鹿千春
园子的姐姐，铃木家长女。和妹妹不同，很有名家之女的风范，待人很温和。和富泽财团的三子富泽雄三有婚约。
铃木次郎吉（すずき じろきち）
配音演员：永井一郎→富田耕生
铃木史郎的堂兄，铃木财团的顾问。爱好环游世界。十分痛恨怪盗基德，一直扬言要抓住基德，不过从来没成功过。爱犬的名字叫“鲁邦”。
西野真人（にしの まさと）
配音演员：宫本充
剧场版原创人物，登场于《世纪末的魔术师》。铃木史郎的秘书。曾旅居世界各国，擅长多国语言。
魔术快斗客串人物
怪盗基德（かいとう キッド）
全称“怪盗1412号”，以世界各地的珠宝为目标的大怪盗。柯南的对手之一。第一代为黑羽盗一，目前活动的为第二代——黑羽快斗。
《魔术快斗》的主人公，高中二年级学生，第二代怪盗基德，为了探查杀害父亲盗一的组织消息，一直在找寻神秘之石“潘多拉”。（注意：青山刚昌已明确表明此神秘组织与黑衣组织不是同一个组织）
黑羽盗一（くろば とういち）
配音演员：池田秀一
天才魔术师，第一代怪盗基德，快斗的父亲。黑羽快斗、工藤有希子、贝尔摩德的变装术都是师承于他。8年前在魔术表演中遭神秘组织暗杀身亡。
中森青子（なかもり あおこ）
配音演员：岩居由希子→高山南→藤村步→M·A·O《魔术快斗》主角之一，快斗的青梅竹马，中森银三的女儿，不知道快斗就是怪盗基德。在《名侦探柯南》中仅在动画中正式登场，漫画中没有出现其姓名。
中森银三（なかもり ぎんぞう）
配音演员：石冢运升
警视厅刑事部搜查二课智能犯搜查系的警部，中森青子的父亲。专门负责怪盗基德的案件。十分执着于捉拿怪盗基德，但几乎每次都以失败告终。
小泉红子（こいずみあかこ）
配音演员：林原惠美→泽城美雪→喜多村英梨《魔术快斗》主角之一，拥有神秘气质的魔女，赤魔法的正统继承人。在《名侦探柯南》中仅在动画中登场，且未表现其使用魔法。
白马探（はくば さぐる）
配音演员：石田彰→宫野真守
《魔术快斗》主角之一，从英国留学归来的高中生侦探，白马警视总监的儿子，基德的主要对手。有一股少爷的骄傲气质。在《名侦探柯南》中侦探的聚会、比赛类型的故事中客串登场。
黑衣组织
那位先生（Boss）
黑衣组织的首领，已登场。被组织成员呼为“那位先生”或“Boss”，没有酒类代号，组织成员的代号都是他所起。除此之外一切信息不明。
朗姆（Rum）
黑衣组织的二号人物，Boss的心腹。性别不明，外貌有多种传闻。在事故中某只眼睛负伤，所以装的是义眼。
琴酒（Gin）
配音演员：堀之纪
黑衣组织重要成员。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。在组织中负责重要的交易、暗杀及铲除不合格的成员的任务。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。
伏特加（Vodka）
配音演员：立木文彦
经常跟随在琴酒身边的黑衣组织成员。
贝尔摩德（Vermouth）
配音演员：小山茉美
真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克丽丝·温亚德。被称为“神秘主义者”。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（宫野志保，即灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。
波本（Bourbon）
配音演员：古谷彻
本名降谷零，化名安室透。29岁，餐厅服务生，真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底。被称为“神秘主义者”。对柯南的身份产生了兴趣。与赤井秀一相互反感，曾伪装成伤疤赤井来试探FBI，后推断出赤井未死和赤井假扮为冲矢昴活动。
基安蒂（Chianti）
配音演员：井上喜久子
组织的狙击手，与科恩搭档。很讨厌贝尔摩德。
科恩（Korn）
配音演员：木下浩之
组织的狙击手。
基尔（Kir）
即CIA探员水无怜奈。
雪莉（Sherry）
本名宫野志保，黑衣组织的科学家，“APTX4869”的发明者。因姐姐宫野明美被杀反抗组织，打算服APTX4869自尽，身体却意外变成了小孩，逃离组织后化名灰原哀。
黑麦威士忌（Rye）
即FBI搜查官赤井秀一，以诸星大的化名潜入组织，身份暴露后脱离组织。
沼渊己一郎（ぬまぶち きいちろう）
配音演员：龙田直树
黑衣组织底层成员。组织原本想培训他成为杀手，后准备将其进行人体试验。逃脱后因强盗杀人被捕。后因想再看看萤火虫，谎称埋尸于群马深山中，伺机逃脱，之后又再次被捕。
龙舌兰（Tequila）
配音演员：广田行生
身材高大的壮汉，关西口音。后来被卷入某起案件而被炸死。
皮斯克（Pisco）
配音演员：村松康雄
本名枡山宪三。曾经一度掌握了雪莉的所在，但后来由于射杀吞口议员的画面被拍下，而遭琴酒灭口。
卡尔瓦多斯（Calvados）
组织的狙击手。在一次行动中被赤井击伤后自杀。
苏格兰威士忌（Scotch）
日本公安警察派入组织的卧底，安室透的同事。卧底身份暴露后，在被组织问出名字之前被杀身亡。
宫野明美（みやの あけみ）
配音演员：胜生真沙子→玉川砂记子
宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。
宫野厚司（みやの あつし）
配音演员：无
科学家，明美和志保的父亲。被组织其他成员声称“因意外事故身亡”。
宫野艾莲娜（宫野 エレーナ）
配音演员：铃木弘子
科学家，明美和志保的母亲。被组织其他成员声称“因意外事故身亡”。
楠田陆道（くすだ りくみち）
配音演员：岩田光央
组织派出的卧底，为了寻找失踪的基尔而被组织安排装病住进杯户中央医院进行秘密调查，被识破后开车逃亡途中开枪自杀。
爱尔兰（Irish）
配音演员：干本雄之
剧场版原创人物，登场于剧场版《漆黑的追踪者》。为了调查某个与组织成员有关的案件而被黑衣组织安插进警视厅搜查小组。通过指纹对比得知柯南身份。最后被基安蒂射杀。
就先介绍这么多了。
☆、楔子，穿越
“唉——”君影叹气中。“怎么了？不是把花精灵王以及恶灵收集齐了吗？怎么叹气了？”红雨好奇地问。“我原本想再去一个世界的，可是冷月沉睡了，我没办法去。”“我有办法帮你。”这时，一位美丽的女子出现了，她就是普普拉花神。“什么办法？”君影问。“我会让你穿越，不过代价是你会失去记忆并且要完成一个任务。”普普拉花神说道。“行，不过是什么任务？”君影可是个任务狂，一提到任务，眼睛闪闪发光啊！“我要你去名侦探柯南的世界，拆散三对～～”普普拉花神小小的腹黑了一下，说到。“行！”君影立马答应了，因为她实在不想柯南他们已经有喜欢的人了。然后，普普拉花神把她送进了柯南的世界里……